MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Isoptericola variabilis 225 chromosome

Total Repeats: 109926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015588	CTCG	2	8	38	45	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015588	CAG	2	6	137	142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015588	CCCT	2	8	165	172	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_015588	GC	3	6	269	274	0 %	0 %	50 %	50 %	334335561
5	NC_015588	TCA	2	6	285	290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335561
6	NC_015588	CG	3	6	354	359	0 %	0 %	50 %	50 %	334335561
7	NC_015588	GTC	2	6	403	408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335561
8	NC_015588	ACG	2	6	462	467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
9	NC_015588	GCC	2	6	499	504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335561
10	NC_015588	CCCG	2	8	547	554	0 %	0 %	25 %	75 %	334335561
11	NC_015588	AGC	2	6	561	566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
12	NC_015588	GCC	2	6	647	652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335561
13	NC_015588	GTCGCG	2	12	653	664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334335561
14	NC_015588	CTG	2	6	731	736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335561
15	NC_015588	CGTGCG	2	12	775	786	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334335561
16	NC_015588	GGA	2	6	799	804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335561
17	NC_015588	TCA	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335561
18	NC_015588	CGACGT	2	12	871	882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334335561
19	NC_015588	CTC	2	6	884	889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335561
20	NC_015588	CGA	2	6	892	897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
21	NC_015588	GGA	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335561
22	NC_015588	TTC	2	6	938	943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334335561
23	NC_015588	CAA	2	6	970	975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334335561
24	NC_015588	GTC	2	6	980	985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335561
25	NC_015588	AGC	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
26	NC_015588	TCA	2	6	1059	1064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335561
27	NC_015588	GCC	2	6	1075	1080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335561
28	NC_015588	AAG	2	6	1112	1117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334335561
29	NC_015588	GCG	2	6	1118	1123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335561
30	NC_015588	AGCG	2	8	1124	1131	25 %	0 %	50 %	25 %	334335561
31	NC_015588	GC	3	6	1203	1208	0 %	0 %	50 %	50 %	334335561
32	NC_015588	GCA	2	6	1243	1248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
33	NC_015588	TCA	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335561
34	NC_015588	CGA	3	9	1294	1302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
35	NC_015588	CG	3	6	1392	1397	0 %	0 %	50 %	50 %	334335561
36	NC_015588	GCA	2	6	1471	1476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
37	NC_015588	CGG	2	6	1480	1485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335561
38	NC_015588	AAG	2	6	1517	1522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334335561
39	NC_015588	AGC	3	9	1590	1598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335561
40	NC_015588	GCG	2	6	1639	1644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015588	CCG	2	6	1648	1653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015588	CG	3	6	1678	1683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015588	CG	3	6	1686	1691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015588	GTCC	2	8	1747	1754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015588	AC	3	6	1769	1774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015588	CCAC	2	8	1868	1875	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_015588	GCC	2	6	1899	1904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015588	GTCC	2	8	1909	1916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015588	CCG	2	6	1920	1925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015588	CGA	2	6	1942	1947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015588	GAC	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015588	TCA	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015588	GAC	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015588	CGAC	2	8	2125	2132	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015588	CG	4	8	2148	2155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015588	CGT	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015588	GC	3	6	2255	2260	0 %	0 %	50 %	50 %	334335562
58	NC_015588	CGCC	3	12	2273	2284	0 %	0 %	25 %	75 %	334335562
59	NC_015588	GC	3	6	2363	2368	0 %	0 %	50 %	50 %	334335562
60	NC_015588	CCGG	2	8	2415	2422	0 %	0 %	50 %	50 %	334335562
61	NC_015588	CTC	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335562
62	NC_015588	CAA	2	6	2452	2457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334335562
63	NC_015588	GCG	2	6	2502	2507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335562
64	NC_015588	GCT	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
65	NC_015588	ACGC	2	8	2603	2610	25 %	0 %	25 %	50 %	334335562
66	NC_015588	CGC	2	6	2629	2634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335562
67	NC_015588	CGA	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335562
68	NC_015588	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
69	NC_015588	GCT	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
70	NC_015588	ACG	2	6	2805	2810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335562
71	NC_015588	GCG	3	9	2829	2837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335562
72	NC_015588	CGG	2	6	2896	2901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335562
73	NC_015588	TCG	2	6	2922	2927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
74	NC_015588	CCCG	2	8	2938	2945	0 %	0 %	25 %	75 %	334335562
75	NC_015588	CGACG	2	10	2962	2971	20 %	0 %	40 %	40 %	334335562
76	NC_015588	CGC	2	6	2997	3002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335562
77	NC_015588	TCG	2	6	3030	3035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
78	NC_015588	CGA	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335562
79	NC_015588	TCC	2	6	3180	3185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335562
80	NC_015588	GGAC	2	8	3207	3214	25 %	0 %	50 %	25 %	334335562
81	NC_015588	CAA	2	6	3241	3246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334335562
82	NC_015588	TCG	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
83	NC_015588	CTG	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335562
84	NC_015588	GAC	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335562
85	NC_015588	CGCCGT	2	12	3360	3371	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015588	CA	3	6	3395	3400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015588	GGA	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015588	GTC	2	6	3416	3421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
89	NC_015588	TCG	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
90	NC_015588	CAA	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334335563
91	NC_015588	CGG	2	6	3484	3489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
92	NC_015588	GGC	2	6	3544	3549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
93	NC_015588	CGT	2	6	3580	3585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
94	NC_015588	CGG	2	6	3600	3605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
95	NC_015588	CGG	2	6	3637	3642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
96	NC_015588	CAT	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335563
97	NC_015588	GGC	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
98	NC_015588	GC	3	6	3706	3711	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
99	NC_015588	ACGTCG	2	12	3741	3752	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334335563
100	NC_015588	GCG	2	6	3762	3767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
101	NC_015588	TGG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335563
102	NC_015588	GCG	2	6	3804	3809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
103	NC_015588	TCG	2	6	3819	3824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
104	NC_015588	ACC	2	6	3825	3830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335563
105	NC_015588	CG	3	6	3867	3872	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
106	NC_015588	AGG	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335563
107	NC_015588	GCT	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
108	NC_015588	CG	3	6	4035	4040	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
109	NC_015588	CGT	2	6	4045	4050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
110	NC_015588	GCT	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335563
111	NC_015588	CG	3	6	4079	4084	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
112	NC_015588	GAG	2	6	4088	4093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335563
113	NC_015588	CGC	2	6	4105	4110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335563
114	NC_015588	CGA	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335563
115	NC_015588	CGA	2	6	4126	4131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335563
116	NC_015588	CG	3	6	4210	4215	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
117	NC_015588	AGG	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335563
118	NC_015588	CAG	2	6	4271	4276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335563
119	NC_015588	CGG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335563
120	NC_015588	GCCG	2	8	4297	4304	0 %	0 %	50 %	50 %	334335563
121	NC_015588	GCC	2	6	4336	4341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335563
122	NC_015588	CTC	2	6	4388	4393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335564
123	NC_015588	TCGAGC	2	12	4422	4433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334335564
124	NC_015588	TCG	2	6	4449	4454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
125	NC_015588	GGGCA	2	10	4463	4472	20 %	0 %	60 %	20 %	334335564
126	NC_015588	TCG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
127	NC_015588	GC	3	6	4564	4569	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
128	NC_015588	CGT	2	6	4570	4575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
129	NC_015588	GC	3	6	4591	4596	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
130	NC_015588	GC	3	6	4649	4654	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
131	NC_015588	CGGC	2	8	4756	4763	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
132	NC_015588	CTC	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335564
133	NC_015588	CGGC	2	8	4806	4813	0 %	0 %	50 %	50 %	334335564
134	NC_015588	CGT	2	6	4834	4839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
135	NC_015588	GCT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
136	NC_015588	GCG	2	6	4881	4886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335564
137	NC_015588	CGGA	2	8	4888	4895	25 %	0 %	50 %	25 %	334335564
138	NC_015588	TCG	2	6	4977	4982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
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140	NC_015588	GCT	2	6	5096	5101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335564
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162	NC_015588	CGGT	2	8	5710	5717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
163	NC_015588	CG	4	8	5750	5757	0 %	0 %	50 %	50 %	334335565
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264	NC_015588	GGCC	2	8	9410	9417	0 %	0 %	50 %	50 %	334335567
265	NC_015588	GCT	2	6	9530	9535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335567
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395	NC_015588	ACA	2	6	13195	13200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334335569
396	NC_015588	CCG	2	6	13204	13209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335569
397	NC_015588	CTCACG	2	12	13230	13241	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334335569
398	NC_015588	CCGT	2	8	13255	13262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
399	NC_015588	CGG	2	6	13325	13330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_015588	TGC	2	6	13346	13351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_015588	TCC	2	6	13435	13440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
402	NC_015588	CGC	2	6	13474	13479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
403	NC_015588	GAG	2	6	13492	13497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
404	NC_015588	GAA	2	6	13506	13511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334335570
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408	NC_015588	CACG	2	8	13726	13733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
409	NC_015588	GTG	2	6	13816	13821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335571
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441	NC_015588	CGC	2	6	14753	14758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
442	NC_015588	CAC	2	6	14821	14826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335572
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458	NC_015588	CCCG	2	8	15393	15400	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
459	NC_015588	GGA	2	6	15412	15417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_015588	CGG	2	6	15795	15800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335573
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482	NC_015588	GTG	2	6	15995	16000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335573
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494	NC_015588	CGT	2	6	16313	16318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
495	NC_015588	GGT	2	6	16385	16390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335574
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499	NC_015588	TCG	2	6	16531	16536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335574
500	NC_015588	GC	3	6	16565	16570	0 %	0 %	50 %	50 %	334335574

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